在阳光明媚的海边小学，康正行（张睿家 饰）是班里的佼佼者，他以出色的领导才能和稳重的性格被选为班长。某天，一个名叫余守恒（张孝全 饰）的多动症孩子转学来到了班上，老师为了帮助余守恒适应新环境，委派康正行作为他的朋友和指导。一开始，余守恒的行为让康正行感到头痛不已。然而，他决心帮助余守恒，慢慢地影响他，让他从一个问题儿童变成一个守规矩的好孩子。在这个过程中，康正行和余守恒建立了深厚的友谊。康正行的内心世界是复杂的。他默默地承受着成长的烦恼和痛苦，对于友谊、爱情和未来的迷茫常常让他感到焦虑。而余守恒的存在仿佛一面镜子，映照出他内心深处的挣扎和困惑。随着时间的推移，康正行开始意识到自己对余守恒的感情超越了友谊。然而，他无法面对自己的感情，选择了逃避。与此同时，余守恒也在经历着成长的烦恼和变化。最终，康正行鼓起勇气，决定向余守恒坦白自己的感情。但当他面对余守恒时，却发现自己的感情早已被对方所觉察。这段青涩的青春记忆，成为他们心中永远的秘密和遗憾。《盛夏光年2006》通过康正行和余守恒的故事，展现了青春期的困惑、挣扎和成长。影片中的情感纠葛、友谊与爱情交织，使得这部电影成为了一部感人至深的青春佳作。