电影的故事围绕主角风祭真和一个神秘的财团之间的恩怨展开。风祭真的父亲是遗传学研究所里的科学家，他被财团的ISS所长欺骗，为其进行研究。风祭真为了帮助父亲研制出不治之症的药物，毅然自愿成为人体实验者，却不知道这一切都是财团的阴谋，他们的真正目的是研究生化战士，用于军事用途。财团的科学家鬼塚对风祭真进行了最危险的生化实验，将他的遗传因子与蝗虫的结合，使他变成了半人半蝗虫的怪物，也就是真·假面骑士。1风祭真在变身后，失去了自己的意识，只有强烈的复仇欲望。他开始对财团的成员进行残酷的杀戮，不惜牺牲自己的爱人明日香爱，也要报复那些害了他的人。他的对手是另一个改造人士兵，也就是鬼塚本人，他也被注射了蝗虫的基因，成为了另一个假面骑士。两个假面骑士之间展开了一场惨烈的战斗，最终风祭真杀死了鬼塚，但也付出了沉重的代价。1电影的结尾，风祭真带着他和明日香爱所生的婴儿，也就是风祭新，离开了研究所。风祭新是一个基因生命体，他也有着假面骑士的潜能，他的未来将会如何，电影没有揭示。1